MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56D

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017485	TTA	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017485	AAAT	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017485	ACTC	2	8	137	144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017485	CTA	2	6	157	162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017485	TGT	3	9	174	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017485	T	7	7	262	268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017485	TCA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017485	TTG	2	6	445	450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017485	A	7	7	459	465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017485	GTT	2	6	500	505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017485	A	7	7	673	679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017485	TA	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017485	A	9	9	735	743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017485	GGA	2	6	758	763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017485	TA	3	6	792	797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017485	TA	3	6	814	819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017485	TA	3	6	836	841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017485	ATA	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017485	GAA	2	6	2495	2500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017485	A	8	8	2512	2519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017485	AAAAG	2	10	2525	2534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017485	ACAG	2	8	2545	2552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017485	ACAG	2	8	2556	2563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017485	A	6	6	2573	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017485	CAGA	2	8	2579	2586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017485	TTA	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017485	AAT	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017485	TTG	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017485	A	6	6	3399	3404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017485	A	6	6	3415	3420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017485	TGTT	2	8	3421	3428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017485	AG	3	6	3447	3452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017485	ATA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017485	T	7	7	3864	3870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017485	ATA	2	6	3882	3887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017485	AGG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017485	TAG	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017485	ACT	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017485	T	7	7	5132	5138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017485	TGAA	2	8	5189	5196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.